Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem87bQ8BKU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms