Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnrc6bQ8BKI2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms