Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcal1Q8BJL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms