Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms