Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af1l4Q8BGJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1l4Q8BGJ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms