Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samm50Q8BGH2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samm50Q8BGH2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms