Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4bQ8BGE6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4bQ8BGE6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms