Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dusp4Q8BFV3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dusp4Q8BFV3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dusp4Q8BFV3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms