Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd4Q8BFT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms