Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Srgap3Q812A2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srgap3Q812A2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms