Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cracr2bQ80ZJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cracr2bQ80ZJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms