Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ttc28Q80XJ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc28Q80XJ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ttc28Q80XJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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