Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed4Q80WQ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed4Q80WQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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