Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc155Q80VJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc155Q80VJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc155Q80VJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms