Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3cQ80U95 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3cQ80U95 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms