Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccp110Q7TSH4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccp110Q7TSH4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms