Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uhrf2Q7TMI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms