Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TwistnbQ78WZ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms