Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6dQ76KF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6dQ76KF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms