Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme8Q715T0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme8Q715T0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms