Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

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Length 909 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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March6Q6ZQ89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
March6Q6ZQ89 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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March6Q6ZQ89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
March6Q6ZQ89 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms