Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Efr3bQ6ZQ18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Efr3bQ6ZQ18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Efr3bQ6ZQ18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Efr3bQ6ZQ18 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Efr3bQ6ZQ18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Efr3bQ6ZQ18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efr3bQ6ZQ18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efr3bQ6ZQ18 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms