Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Smpd4Q6ZPR5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd4Q6ZPR5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms