Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a1Q6X893 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms