Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl3Q6W5C0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcl3Q6W5C0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms