Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rhox8Q6VSS7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rhox8Q6VSS7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rhox8Q6VSS7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms