Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudcd1Q6PIP5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudcd1Q6PIP5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudcd1Q6PIP5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms