Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sort1Q6PHU5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sort1Q6PHU5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sort1Q6PHU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms