Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf316Q6PGE4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf316Q6PGE4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf316Q6PGE4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms