Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc85bQ6PDY0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms