Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms