Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb39Q6PDK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb39Q6PDK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb39Q6PDK0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms