Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd13aQ6PDE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms