Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak1Q6PD31 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trak1Q6PD31 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms