Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc4Q6PAV2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc4Q6PAV2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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