Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms