Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsen2Q6P7W5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsen2Q6P7W5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsen2Q6P7W5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms