Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NesQ6P5H2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NesQ6P5H2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms