Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C5

Smug1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smug1Q6P5C5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smug1Q6P5C5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms