Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig8Q6P3A4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vsig8Q6P3A4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms