Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc189Q6NZQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms