Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Soga3Q6NZL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Soga3Q6NZL0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms