Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms