Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asic1Q6NXK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asic1Q6NXK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms