Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rprd2Q6NXI6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rprd2Q6NXI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rprd2Q6NXI6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms