Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc3bQ6NWW9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms