Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms