Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt39Q6IFX4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms