Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt40Q6IFX3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt40Q6IFX3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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