Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edrf1Q6GQV7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Edrf1Q6GQV7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edrf1Q6GQV7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345 ms